Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms