Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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