Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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