Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms