Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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