Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc30Q8BVF4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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