Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem87bQ8BKU8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem87bQ8BKU8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms