Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Amigo1Q80ZD8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Amigo1Q80ZD8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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