Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp3Q7TNH6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms