Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms