Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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