Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms