Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkab2Q6PAM0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms