Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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