Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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