Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms