Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms