Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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