Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Taf6Q62311 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms