Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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