Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cln3Q61124 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cln3Q61124 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cln3Q61124 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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