Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3aQ60520 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3aQ60520 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms