Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim38Q5SZ99 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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