Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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