Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CenpjQ569L8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CenpjQ569L8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CenpjQ569L8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CenpjQ569L8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CenpjQ569L8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpjQ569L8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms