Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shank3Q4ACU6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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