Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ulk4Q3V129 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2102.2 ms