Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms