Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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