Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BB287469Q3UT53 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BB287469Q3UT53 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms