Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms