Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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