Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf224Q3UIW8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms