Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX0

Nol8, Nucleolar protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol8Q3UHX0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol8Q3UHX0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol8Q3UHX0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms