Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Arfgef3Q3UGY8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms