Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms