Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LbrQ3U9G9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms