Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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