Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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