Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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