Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim63Q38HM4 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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