Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms