Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd11Q1RNF8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms