Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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