Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms