Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc39dQ0VF76 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc39dQ0VF76 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc39dQ0VF76 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc39dQ0VF76 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc39dQ0VF76 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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