Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms