Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms