Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms