Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms